为了革新僵化的天宫，太上老君暗中指示阎罗王设局引诱孙悟空进入高层。在一系列精心策划的事件后，孙悟空被送上天庭，误食了太上老君的特制药物，身体得到强化，拥有了钢筋铁骨和洞察一切的火眼金睛，成为一股不可忽视的力量。
然而，就在太上老君的计划即将成功之际，西方的佛教领袖如来插手，控制了孙悟空。如来命令观音菩萨和弟子金蝉子收留了被天庭追责的孙悟空、天蓬元帅、卷帘大将以及西海三太子小白龙，让他们前往天竺学习佛法，并在人间传播佛教教义。天庭因欠如来人情，只能默许这一切，眼睁睁看着道教影响力被削弱。
对此，太上老君愤愤不平，他开始策划新的布局，意图整顿西方佛教。得知如来欲抹除孙悟空，他担忧直接干预会导致神明间的冲突，于是将一个能收集并修复灵魂的天元护魂瓶，以及一颗能存储意识的九转凝神丹交给六耳猕猴。孙悟空将自己的意识备份到丹药中，由六耳猕猴保管。
在如来面前，六耳猕猴忍痛击杀了孙悟空，同时利用天元护魂瓶保存了孙悟空的一缕魂魄。为了让孙悟空了解真相，六耳猕猴将自己执行任务的视频附在丹药上。六耳猕猴成佛后，将护魂瓶和凝神丹交给了在冥界不受如来重视的阎罗王。
阎罗王在遥远的星球上找到了一个灵脉汇聚之地，重现了石猴诞生的情景，按照地球历法布置了一块灵石。他期待着有一天能用护魂瓶滋养孙悟空的三魂七魄，再用九转凝神丹唤醒他，让齐天大圣重获新生。
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