顺便说一下，种子与细心，本来是两个东西，但后来唯识学者根据经义，很巧妙地将这两种思想结合起来，构成了唯识学说的重要理论，并奠定了唯识义理的深厚基础。
从公元三、四世纪起，大乘唯识学开始在印度形成、建立，并迅速发展起来。到了六至七世纪唯识学发展到了鼎盛时期。大乘唯识思想的发展大致经历了以下三个阶段。
经典时代的唯识学，唯识学所依据的大乘经典有六部，即：《解深密经》、《大方广佛华严经》、《如来出现功德经》、《大乘阿毗达磨经》、《楞伽经》、《厚严经》。其中最根本、最重要的是《解深密经》，它是唯识学的正依。唯识学的主要思想和核心理论在这部经中都基本上提到了。如：在间断的六识外，确立了阿赖耶识的存在，作为轮回的主体；在种识现起一切的思想下，确立了唯识无境的原理；在“一切法相品”和“无自性相品”中，提出了唯识的重要理论－－三性、三无性等。唯识学是依三性，即遍计所执性、依他起性和圆成实性来抉择一切法，并认为说一切法皆空是不了义，只有遍计所执性是空的，依他起性和圆成实性都是有的。可以说《解深密经》基本上奠定了唯识学的理论基础，是唯识学最主要的经典依据。《大方广佛华严经》、《楞伽经》、《厚严经》都不是纯粹的唯识的思想，同时包含了如来藏的思想在内。《如来出现功德经》、《大乘阿毗达磨经》在华夏都没有译本。
论典时代的唯识学，此时的唯识思想主要是指弥勒学、无着学和世亲学，这是唯识学逐步确立和完善的重要时期。在此需要对大乘唯识学产生的思想和时代背景作一简要的说明。众所周知，唯识学是在龙树大乘中观学之后产生的，此时己是佛灭七百年后，随着性空思想的逐渐衰落，印度大乘佛教出现了很多问题，对龙树空义思想产生了种种误解，甚至出现了“恶取空”，否定一切的极端倾向。与此同时，秘密的“如来藏我”思想也很突出，专说一乘，不可避免的含有神我之意。在这种情况下，佛灭九百年后，无着、世亲两大论师，继承、发展了弥勒之学，广造经论，大力弘扬大乘唯识学，其目的就是为了纠正当时人们的错误知见，让佛法走入正道。而此时已是佛在《阿含经》中所预言的“佛灭五百年后有诸相似伪宝出于世间，伪宝出已，真宝则没”的像法时期了。
弥勒菩萨被认为是唯识学的开山祖师，但严格来说，弥勒的思想并不限于唯识。弥勒的唯识学是由无着传出的，一般认为，弥勒就是在兜率内院的一生补处菩萨，也就是当来人间的未来佛。但也有人认为是当时真实的历史人物。汉传的弥勒五论是：《瑜伽师地论》、《大乘庄严论颂》、《分别瑜伽论》、《金刚般若论颂》、《辨中边论颂》。藏传没有《分别瑜伽论》、《金刚般若论颂》，与之相应的是《现观庄严论颂》和《辨法法性论》，共同具有的三部论是《瑜伽师地论》、《大乘庄严论颂》、《辨中边论颂》。其中，《瑜伽师地论》被公认是唯识学的根本论典。
无着论师。传说他曾上升兜率天向弥勒菩萨请法，学习《瑜伽师地论》，对唯识学的创立与发展作出了巨大的贡献。无着的主要论典有：《显扬圣教论》、《摄大乘论》、《阿毗达磨集论》等。其中，《显扬圣教论》可以说是《瑜伽师地论》的大纲；《摄大乘论》是建立唯识理论的核心，对阿赖耶识和三性等问题作了详尽的说明与论证，本论是解释《大乘阿毗达磨经》的，被认为是无着的代表作品；《阿毗达磨集论》是建立唯识法相的重要论典。
世亲论师是无着论师的弟弟，曾大力宣扬小乘教义，后受其兄影响，信受大乘，广造经论，弘扬大乘唯识学。他将唯识学说加以严密组织，使之系统化、条理化，可以说是唯识学的集大成者。世亲论师的主要的唯识论着有：《百法明门论》、《唯识二十颂》、《唯识三十颂》、《辨中边论释》等，其中《唯识三十颂》是按照唯识相、唯识性、唯识位的次第，配合境、行、果的修学程序，建立了严密的组织，是世亲晚年一部具有代表性和总结性的唯识学着作。在完成了《唯识三十颂》后，世亲论师本来打算为颂文再写一部释论，可惜这个愿望没有实现就去世了，因此这个任务就留给了后来的唯识论师们了。
尽管无着与世亲一脉相承，但他们的思想还是有很大的差异。世亲的思想比较复杂，对阿赖耶识和如来藏两大体系都有很深的造诣，而在无着的论着中却很难找到有关如来藏和佛性等思想。此外，我们还可以从《摄大乘论》和《唯识三十颂》看出两家唯识思想的主要差异：关于“能变识”，世亲是立三能变，即阿赖耶识、末那识、前六识都是能变识，重在以现行识来说明赖耶受熏持种、末那为执藏等唯识义。无着则只立“一能变”，对阿赖耶识是重在种子识的说明。
唯识学所依据的十一论是：《瑜伽师地论》、《显扬圣教论》、《大乘庄严论》、《集量论》、《摄大乘论》、《十地经论》、《分别瑜伽论》、《观所缘缘论》、《唯识二十颂》、《辨中边论》、《阿毗达磨集论》，其中，以《瑜伽师地论》为正依。该论共分为五分：本地分、摄抉择分、摄释分、摄异门分、摄事分，具体说明瑜伽师所行的十七地。其中，又以 “本地分”最为根本，心、意、识、八识、种子与熏习、转依等重要理论和思想在“本地分”中都很明白地说到了。本论提出了证明阿赖耶识存在的八大理由，即执受证、初受生证、明了证、种子证、业用证、身受证、无心定证、命终证。又以四相建立流转、一相建立还灭，于流转四相中，明确提出末那识说，从而完成了八识唯识说的思想体系。
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