到了公元461年春季，正月初一，戊午朔日，朝廷举行朝贺大典。雪花落在太宰刘义恭的衣服上，都是六瓣形状，刘义恭上奏称这是吉祥的瑞兆，孝武帝听后十分喜悦。刘义恭深知孝武帝猜忌残暴，担心自身难保，平日里总是言辞谦卑、神色恭顺，刻意曲意奉承；因此在孝武帝在位期间，始终得以幸免灾祸。
二月初四，北魏文成帝前往中山；十九日，抵达邺城，随后又前往信都。
三月，南朝宋派遣使者出使北魏。
北魏文成帝征发并州、肆州百姓五千人，修缮河西地区的狩猎通道；三月二十五日，返回平城。
夏季，四月初八，南朝宋将西阳王刘子尚改封为豫章王。
四月十五日，孝武帝下诏开始修建明堂，在丙、己方位直接建造大殿，形制仿照太庙，仅以十二间的规模与太庙有所区别。
雍州刺史、海陵王刘休茂年仅十七岁，由司马、新野人庾深之代理府中事务。刘休茂性情急躁，想要独断专行，庾深之及军中主帅常常对他加以约束，他因此心怀怨恨。身边侍从张伯超受到宠信，却多有不法行径，主帅多次斥责他。张伯超惧怕被治罪，便劝说刘休茂：“主帅暗中记录您的过失，打算上报朝廷，这样下去恐怕会有不测。”刘休茂问道：“那该怎么办？”张伯超说：“只有杀掉代理府事的庾深之和主帅，起兵自卫。这里距离都城数千里，即便大事不成，也能逃入胡虏境内称王。”刘休茂听从了他的建议。
四月二十日夜半，刘休茂与张伯超等人率领贴身护卫队，在城中杀死典签杨庆，冲出金城，又斩杀庾深之及典签戴双；随后征集士兵民众，树立军旗、传布檄文，逼迫僚属推举自己为车骑大将军、开府仪同三司，加授黄钺（象征生杀大权）。侍读博士荀诜劝谏，被刘休茂杀害。张伯超独揽军政大权，生杀予夺全由自己决定，刘休茂身边的侍从曹万期挺身而出，挥刀砍向刘休茂，未能成功而战死。
刘休茂出城巡视军营，咨议参军沈畅之等人率领部众关闭城门，拒绝他返回。刘休茂驰马赶回，无法入城。义成太守薛继考全力协助刘休茂攻城，最终攻破城门，斩杀沈畅之及同谋数十人。当天，参军尹玄庆再次起兵攻打刘休茂，将其生擒后斩首，刘休茂的母亲、妻子都自杀身亡，同党全部伏法。城中陷入混乱，无人统领。中兵参军刘恭之是刘秀之的弟弟，众人共同推举他代理府州事务。薛继考用兵胁迫刘恭之，让他撰写奏表，声称“薛继考举义平叛”，随后自己乘坐驿车返回都城；孝武帝任命他为北中郎咨议参军，赐爵冠军侯；不久事情败露，薛继考被诛杀。朝廷任命尹玄庆为射声校尉。
孝武帝自即位以来，就极力贬抑各位弟弟；攻克广陵、诛杀刘诞后，想要进一步收紧对诸王的限制。沈怀文劝谏道：“汉明帝不允许自己的儿子与光武帝的儿子享受同等待遇，前代史书将此事传为美谈。陛下已经明辨了管叔、蔡叔那样的叛乱之徒并加以诛灭，希望能推崇唐叔、卫康叔那样的分封托付之道。”等到襄阳平定后，太宰刘义恭揣摩到孝武帝的心意，便再次上表请求限制诸王权力，不让他们担任边州刺史，要求他们全部上缴武器铠甲，禁止与宾客交往；沈怀文坚决反对，认为不可行，此事才作罢。
孝武帝打猎游乐毫无节制，曾经外出游玩，深夜才返回，下令打开城门。侍中谢庄留守宫中，认为城门信物可能有假，坚持不奉旨开门，必须见到皇帝的亲笔敕令才放行。后来孝武帝在宴饮时，从容问道：“你是想效仿郅君章（东汉时以严正着称的官员）吗？”谢庄回应道：“臣听闻帝王祭祀、狩猎，出入都有固定礼节。如今陛下清晨外出、深夜归来，臣担心不法之徒会趁机伪造诏令作乱。因此必须等待陛下的亲笔敕令，才敢打开城门。”
此时，北魏遭遇大旱，文成帝下诏：“各州郡境内，无论神灵大小，都要清扫神庙、虔诚祈祷；等到粮食丰收，再依照各自的品级祭祀神灵。”于是此前被废弃的各类祭祀都恢复了原样。
秋季，七月二十五日，北魏文成帝册封弟弟拓跋小新成为济阳王，加授征东大将军，镇守平原；拓跋天赐为汝阴王，加授征南大将军，镇守虎牢；拓跋万寿为乐浪王，加授征北大将军，镇守和龙；拓跋洛侯为广平王。
七月二十九日，北魏文成帝巡视山北地区；八月二十四日，返回平城。
八月初五，南朝宋孝武帝册封皇子刘子仁为永嘉王，刘子真为始安王。
九月初一，发生日食。
沈庆之坚决辞让司空一职，柳元景坚决辞让开府仪同三司之位；孝武帝下诏全部批准，但仍下令沈庆之在朝会时的位次排在司空之后，俸禄依照三司标准，柳元景的位次在从公之上。
沈庆之目不识丁，但家中向来富有，家产累计达万金，奴仆数以千计；他曾两次向朝廷捐献钱千万、谷万斛。原本已有四处宅邸，又在娄湖拥有园林房舍；一天夜里，沈庆之带着子孙及内外亲戚迁居到娄湖，将四处宅邸上缴官府。他蓄养了许多歌妓侍妾，终日悠闲无事，尽情享乐，除了朝贺之外从不外出；出行的车马都很朴素，随从不过三五人，遇到他的人都不知道他是三公级别的高官。
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