李景睿的马车离开岭南月余后，一道由内阁明发、加盖皇帝玉玺的诏书，以六百里加急的速度，从京城传往各省，尤其是岭南道与格物书院。诏书的到来，在已然习惯了稳步前行的书院里，激起了比上次新皇登基诏书更为剧烈的波澜。
诏书开篇，以皇帝的口吻，盛赞“岭南格物书院，僻处海隅，心系实学，数载以来，于盐政改良、农技推广、器械创新诸务，颇多建树，所育‘格物生’才堪实用，朕心甚慰”。随后，笔锋一转，提出了一个前所未有的构想：
“为彰实学，广聚英才，裨益国计民生，特于京师设立‘大靖皇家科学院’。此院非一般官署，乃专司探究天地万物之理，并将其应用于农、工、医、算、舆地等实务领域之机构。院内设‘院士’，遴选天下通晓格物实学、并有确凿发明创造或重大贡献者担任，秩比五品，专事研究、论学、着述，并可随时应召，为朝廷相关部院提供咨议。”
诏书的核心内容，直接指向了格物书院：“着吏部、工部会同，即行察访岭南格物书院所出之优异者。凡于盐法、农学、算数、地理、百工技艺、乃至医道格物等方面确有专长、成效卓着之生徒，可由书院荐举，经有司考核，聘为皇家科学院首批院士或副院士，入京供职。其原有书院教习、山长云湛，办学有功，特赐金百两，绢五十匹，以示嘉奖。书院本身，仍鼓励其依照现有章程，继续培育实学人才，朝廷当予以关照。”
此外，诏书还粗略规划了科学院的初期架构：下设“数理”、“化生”、“工农”、“舆地医术”等几个“学组”，并提及将拨付内帑银两，于西苑划出土地，建造院舍、实验室、藏书楼及陈列馆。
消息传到书院，致知堂内一片寂静，旋即哗然。赵德柱手捧抄录的诏书文稿，激动得胡须微颤：“皇家科学院！院士秩比五品！这……这是旷古未有的殊荣啊！实学，终于得见天日，获朝廷正式立名建制！”他仿佛看到了自己毕生坚持（后期转向）的学问得到了最高层面的认可，眼眶都有些湿润。
柳文渊则显得更为冷静，他看向云湛：“先生，陛下此举，可谓深谋远虑。既是对书院成果的极大肯定，更是要将‘格物致用’之学，正式纳入朝廷体系，为其正名，并借助书院之力，在京师扎下根来。只是……这聘院士之事……”
云湛神色平静，目光扫过堂下闻讯赶来、表情各异的教习和部分优秀学子。他看到了兴奋、憧憬、跃跃欲试，也看到了茫然、犹豫，乃至一丝不安。
“陛下圣明，立意高远。”云湛缓缓开口，声音清晰地传入每个人耳中，“设立皇家科学院，为实学开辟一方独立探究、施展的天地，此乃国家之福，亦是我等致力于格物致用者之所盼。”
他话锋微转：“至于征聘院士一事，既是机遇，亦是考验。机遇在于，诸生所学，可直达天听，于更广阔之舞台施展，直接影响国策与民生改良；考验在于，京师非岭南，科学院虽立意甚佳，然其如何运作，能否保持独立探究之精神，免受官场习气侵扰，尚未可知。”
他看向那些面露向往的学子：“凡我书院生徒，若有志于应选，须得想清楚：尔等所追求的，是五品官身的荣耀，还是继续深入探究格物之理、并将其真正用于造福百姓的初心？入科学院，虽名为研究，然身处京师，难免涉及咨议、人事、乃至朝堂风向。是否已做好准备，既能坚持学理，又能应对复杂局面？”
他又转向赵德柱、柳文渊等教习：“书院荐举，责任重大。所荐之人，不仅需学问扎实，成果突出，更需品格坚毅，心思沉稳，能代表我书院‘实事求是、精益求精’之风。宁缺毋滥。”
云湛的决定很快传达下去：书院将成立一个临时评议小组，由核心教习和部分高年级学子代表组成，负责受理有意者的申请，并依据其过往学业记录、实践成果、师长同窗评价进行初评，最终拟定一份荐举名单，附详细说明，报送有司。整个过程，公开进行，接受监督。
一时间，书院内议论纷纷。有人连夜整理自己参与盐场建设、农技推广、工坊创新的记录和心得；有人则陷入纠结，既向往京师的广阔平台和官方认可，又舍不得书院相对纯粹的研究环境和未完成的课题（比如“探海一型”的海试、显微镜下的新发现）。也有像沈括这样醉心于基础探究的学子，明确表示暂无兴趣，更愿留在书院继续他的化学与显微研究。
陈万钧闻讯，特意赶来，既为书院高兴，也隐含担忧：“云山长，陛下此招高明啊。如此一来，书院最精华的人才，恐被吸纳不少。长此以往……”
云湛淡然一笑：“陈员外，人才流动，并非坏事。若他们真能在科学院发挥作用，推动更多地方受益，正是书院所愿。至于书院本身，只要‘格物致用’之精神不倒，探索与实践之风气不衰，自会吸引和培养出新的人才。况且，赴京者，亦可成为书院与京师、与朝廷沟通的桥梁，并非断线。”
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