冬季，十月，癸丑（十八日）， 光武帝进入洛阳，临幸南宫，于是定都洛阳。
赤眉军发布文书说：“圣公（刘玄）投降的，封为长沙王；超过二十天，就不再接受投降。”更始帝派刘恭请求投降，赤眉军派将领谢禄前往受降。更始帝跟随谢禄，袒露上身，向刘盆子献上皇帝玺绶。赤眉军让更始帝坐下，安置在庭院中，准备杀掉他；刘恭、谢禄替他求情，未能获准，于是将更始帝拉了出去。刘恭追着喊道：“我已经竭尽全力了，请让我先死！”拔剑就要自刎。樊崇等人急忙一起救下他。于是赦免了更始帝，封为畏威侯。刘恭又坚决请求，更始帝最终得以被封为长沙王。更始帝常依靠谢禄居住，刘恭也保护他。
刘盆子住在长乐宫，三辅地区的郡县、营寨首领派使者前来进贡，赤眉军士兵总是中途抢夺，还多次残暴地掠夺官吏百姓，因此各地又重新坚守堡垒。百姓不知该归附谁，听说邓禹的军队乘胜独能攻克地方且军纪严明，都望风携家带口迎接邓禹的军队，投降的人每天数以千计，部众号称百万。邓禹每到一处，总是停车竖起符节来慰劳归附的百姓，父老、儿童，垂发少年、白发老人挤满在他的车下，无不感动喜悦，于是邓禹名震关西。各位将领和豪杰都劝邓禹直接攻打长安，邓禹说：“不能这样。现在我们人数虽多，但能打仗的士兵少，前方没有可依靠的粮草储备，后方没有转运供给的粮道；赤眉军刚刚攻占长安，财物粮食充足，锋芒锐不可当。盗贼群居，没有长远的打算，财物粮食虽然多，但变故万端，岂能坚守呢！上郡、北地、安定三郡，地广人稀，粮食丰饶，牲畜众多，我们暂且让军队在北道休整，就地取粮养兵，以观察赤眉军的弊端，然后才能设法对付。”于是率军北上到达栒邑县，所到之处，各营堡郡县都打开城门归附。
光武帝派遣岑彭攻打荆州地区的各路贼寇，攻下犨县、叶县等十余城。十一月，甲午（疑误，或为十一月某日）， 光武帝到达怀县。
梁王刘永在睢阳称帝。
十二月，丙戌（二十二日）， 光武帝返回洛阳。
三辅地区的百姓苦于赤眉军的暴虐，都同情更始帝，想偷偷救他出来；张卬等人深感忧虑，派谢禄将更始帝勒死。刘恭连夜前往，收殓埋葬了他的尸体。光武帝下诏命邓禹将更始帝安葬在霸陵。中郎将宛城人赵熹将要出武关，在路上遇到更始帝的亲属，全都赤身露足，饥饿困顿，赵熹竭尽自己的财物粮食接济他们，护送他们前行。宛王刘赐听说后，将他们迎回故乡。
隗嚣回到天水，又重新聚集部众，恢复旧业，自称西州上将军。三辅地区的士大夫为避乱大多归附隗嚣，隗嚣倾心结交，像平民一样与他们交往；任命平陵人范逡为师友，前凉州刺史河南人郑兴为祭酒（学官之长），茂陵人申屠刚、杜林为治书（文书官），马援为绥德将军，杨广、王遵、周宗以及平襄人行巡、阿阳人王捷、长陵人王元为大将军，安陵人班彪等人为宾客，由此名震西州（陇右地区），威名传到崤山以东。马援年轻时，因家庭用度不足辞别哥哥马况，想到边郡去垦田放牧。马况说：“你有大才，应当晚成。好工匠不把未雕琢的玉石给人看（意谓大器晚成），暂且按你的喜好去做吧。”于是马援到北地郡垦田放牧。他常对宾客说：“大丈夫立志，处境越穷困，意志应当越坚定；年纪虽老，志气应当越壮。”后来拥有数千头牲畜，数万斛粮食，不久又叹息道：“凡是经营财产，贵在能赈济施舍，否则就是守财奴罢了！”于是把全部家产分给了亲朋故旧。听说隗嚣礼贤下士，就去投奔他。隗嚣非常敬重马援，与他一起筹划决策。班彪，是班穉的儿子。
当初，平陵人窦融世代在河西地区做官，了解当地的风土人情，他与更始帝的右大司马赵萌关系很好，私下对兄弟们说：“天下安危尚未可知。河西地区富庶，以黄河为屏障，张掖属国（汉朝安置归附少数民族的地区）有精兵万骑，一旦形势危急，封锁黄河渡口，足以自守，这是保留家族血脉的好地方！”于是通过赵萌请求前往河西。赵萌向更始帝推荐窦融，任命他为张掖属国都尉。窦融到任后，安抚结交豪杰，怀柔招纳羌人、胡人，很得他们的欢心。这时，酒泉太守安定人梁统、金城太守库钧、张掖都尉茂陵人史苞、酒泉都尉竺曾、敦煌都尉辛肜，都是州郡的人才，窦融都与他们交好。等到更始政权失败，窦融与梁统等商议说：“如今天下大乱，不知该归附谁。河西地区孤立地处在羌人、胡人中间，如果不同心协力，就不能自守；我们权力均等，力量相齐，又无法统率，应当推举一人为大将军，共同保全河西五郡，观察时局变化。”商议既定，但各自谦让。按地位次序，共同推举梁统；梁统坚决推辞，于是推举窦融代理河西五郡大将军职务。武威太守马期、张掖太守任仲都是孤立没有党援的，窦融等人就共同写信通知他们，二人立即交出印绶离职。于是任命梁统为武威太守，史苞为张掖太守，竺曾为酒泉太守，辛肜为敦煌太守。窦融仍居住在张掖属国，兼任都尉职务照旧；设置从事，监察五郡。河西地区民俗质朴，而窦融等人的施政也宽厚平和，上下相亲，一片安定富庶的景象。他们修整兵马，练习作战射箭，设置烽火台，羌人、胡人侵犯边塞，窦融总是亲自率领各郡军队救援，每次都能如期而至，屡次击败敌人。后来羌人、胡人都敬畏归附，内地躲避战乱和饥荒的流民前来归附的络绎不绝。
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