很多人觉得王氏家族受了冤枉。谏大夫杨宣给皇帝上密奏说：“孝成皇帝非常重视宗庙传承，称赞陛下品德高尚，认为陛下能承接天命，他的决策深远，对陛下的恩德深厚。想想先帝的心意，难道不是想让陛下继承皇位，好好侍奉太皇太后吗？太皇太后已经七十岁了，多次经历悲伤的事，还下令王氏亲属退避，给丁氏、傅氏让路，连路人看到都感动得流泪，陛下难道不应该有所触动吗？陛下有时候登高远望，难道面对汉成帝的延陵，心里不会感到愧疚吗！”汉哀帝被这番话深深打动，重新封成都侯王商的次子王邑为成都侯。
朱博又上奏说：“汉朝过去的惯例是设置部刺史，他们官职低但奖赏丰厚，所以大家都积极办事、乐于进取。之前废除刺史，改设州牧，州牧的俸禄是真二千石，地位仅次于九卿；九卿有空缺，就从政绩好的州牧里选拔；但能力一般的州牧就只是勉强守住职责而已。这样下去，恐怕工作成效越来越差，违法乱纪的事情也管不住。我请求废除州牧，重新设置刺史，恢复原来的制度。”汉哀帝同意了。六月庚申日，帝太后丁氏去世，汉哀帝下诏让她归葬在定陶共皇的陵园，征调陈留、济阴等附近郡国五万人，负责挖掘墓穴和填土。
当初汉成帝在位的时候，齐地有个叫甘忠可的人伪造了《天官历》《包元太平经》十二卷，说汉朝到了重大变革时期，应当重新接受天命，并把这些教给渤海人夏贺良等人。中垒校尉刘向弹劾甘忠可借助鬼神欺骗皇帝、迷惑众人；甘忠可被关进监狱，认罪后，还没判决就病死了。但夏贺良等人继续私下传播这些内容。汉哀帝即位后，司隶校尉解光、骑都尉李寻向皇帝推荐夏贺良等人，他们都在黄门等待皇帝召见。夏贺良多次被召见，他对汉哀帝说：“汉朝国运中途衰落，应当重新接受天命。汉成帝没有顺应天命，所以才没有子嗣。现在陛下长期生病，灾异现象频繁出现，这是上天在发出警告。应该赶紧更改年号和帝号，这样才能延长寿命，生下皇子，灾异也会消失。如果得到天命却不施行，灾祸就会不断，洪水会泛滥，大火会燃起，百姓将遭受灾难。”汉哀帝长期生病，希望这样做能有效果，就听从了夏贺良等人的建议，下诏大赦天下，把建平二年改为太初元年，自己称为“陈圣刘太平皇帝”，还把计时的漏刻改为一百二十度。
这年秋天七月，把渭城西北原上永陵亭一带作为汉哀帝的陵墓所在地，不迁徙郡国的百姓到那里。
汉哀帝更改年号一个多月后，病情还是老样子。夏贺良等人又想胡乱更改政策，大臣们纷纷反对。夏贺良等人上奏说：“大臣们都不懂天命，应该罢免丞相和御史大夫，让解光、李寻辅佐朝政。”汉哀帝觉得他们说的话没有应验，八月下诏说：“待诏夏贺良等人建议更改年号、帝号，增加漏刻度数，说这样能让国家长治久安。我对这些说法不够坚定，错误地听从了他们的话，希望能给百姓带来福气，结果什么好的应验都没有。有了过错却不改正，那才是真正的过错！六月甲子日发布的诏书，除了赦令以外，其他内容全部废除。夏贺良等人违反正道、迷惑众人，他们的奸诈行为必须彻查到底。”于是把夏贺良等人都关进监狱，处死了。李寻和解光被免去死罪，减罪一等，流放到敦煌郡。
因为一直生病，汉哀帝把以前废除的所有神灵祠庙共七百多所全部恢复，一年里祭祀的次数达到三万七千次。
傅太后一直对傅喜怀恨在心，她让孔乡侯傅晏暗示丞相朱博，让他上奏请求免去傅喜的侯爵。朱博和御史大夫赵玄商量这件事，赵玄说：“傅喜的事之前已经有了结论，现在再这么做，恐怕不合适吧？”朱博却回答：“我已经答应孔乡侯了。普通人之间相互约定，尚且能为对方拼死效力，何况是为了皇上呢！我朱博唯有以死相报！”赵玄听了，只好同意。朱博担心单独弹劾傅喜太过明显，刚好之前大司空汜乡侯何武也因为犯错被免职遣回封国，情况和傅喜类似，于是就一并上奏说：“傅喜、何武之前在位时，对治理国家没什么贡献，现在虽然已经被免职，但他们所受的爵位和封土，并不应该拥有，请求将他们都贬为平民。”
汉哀帝知道傅太后向来怨恨傅喜，怀疑朱博和赵玄是受太后指使，就立刻召赵玄到尚书台询问情况，赵玄承认了实情。汉哀帝下诏，让左将军彭宣和朝中大臣共同审问。彭宣等人上奏弹劾说：“朱博、赵玄、傅晏的行为都违背道义，对皇上不恭敬，请求将他们召到廷尉的监狱中治罪。”最终，汉哀帝将赵玄的死罪减三等；削去傅晏四分之一的食邑户数；派谒者拿着符节召丞相朱博到廷尉处，朱博无奈之下自杀，他的封国也被撤销。
九月，汉哀帝任命光禄勋平当为御史大夫；冬天十月甲寅日，又将平当升任为丞相；因为正值冬季，就暂时先赐给他关内侯的爵位。同时，任命京兆尹平陵人王喜为御史大夫。
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