（此章完全属于剧透，如希望阅读全篇的读者请从头开始看。如果希望速读完整本，或以前看过前来补全的继续阅读。）
故事开始，一位异乡来求学的青年（程远航），被家里人从战火中的故乡送到了科技之都。这里没有亲人，没有朋友，连续在出租屋内待了些许时日的远航，甚至都开始胆怯于上学。但是在父母的催促下，他还是按时去报道了。好在运气不错在这里遇到了他在大屏幕上见的明星（星妍）。两个孤独的人很快就成了朋友，远航也见证了其难为的一面。
因为一款名叫“异我”的游戏盛行，远航便借着假期打工的钱，买下了游玩使用的机器，其价格低廉让远航都有些好奇。在游戏中，远航结识了一位好色的牛仔，也见识了其精湛的枪法，在与星妍碰面后，他们便开始了攻略世界树的挑战。
为了减轻家里的负担，远航在上课的途中打起了临时工，这是一家叫做“妙谋”的公司。在这里，他遇见了一位行为举止怪异的女孩，章玥玥。也结识了一位一直追随在其身旁的剑客，关修杰。只是两人好像隐藏着什么，关系忽近忽远。
攻打世界树的途中，远航接到了一项特殊的任务，“追猎精灵女王”，因为远航想将世界道具“真·精灵之声”送给星妍的愿望没有达成，所有便接下了这个任务，打算拿一个真世界道具的复制品。（第一剧场版）
伏笔：远航做完这个任务，会获得一次复活的机会，但是他从来没死过。
故事进入第二轮（第一季12-24章）：
这里，远航明白了牛仔的家事，也发现了其爱的重量，就如其中的一个章节名一般。探索的途中，他们发现了一个特殊的地图。此时引出特别章节：风雪誓言。
（作者以前写过的一本短篇：
讲述的是一个极北的村子，里面住着几位守村人。大部分人因为受不了这严寒的天气，而去远方的城市生活，唯一原因坚持下来的也就这几位。其中的某一天，村长在雪地里捡到了一位女孩，就好似在沙漠发现了瀑布般离谱。
尽管其他人都不愿意相信，但是见到这位女孩的时候又不得不承认。女孩性格开朗，给村长和村民带来了罕见的快乐，只是快乐并不长久，女孩的家人来接他们了。奇怪的是，女孩并不知道家人，家人也说不明白女孩。不过证件齐全，村长还是将女孩交给了他们。副村长自然不信，跋山涉水去到了远方的城镇，硬是查明了事实，女孩是被拐走了。
村长也是气的捶胸，联合了以前的朋友，带着不多的盘缠，离开了这辈子待着的村镇，硬是去城里的大街小巷寻找女孩的踪迹。途中遇到了零队的成员（《七曲》中的夏墨茹），一其努力下，才找回了女孩。但是女孩最后还是被墨茹接走了，毕竟山区没有什么能吃的。不过墨茹答应的也在后来一一实现。）
原剧中，远航在第一季度收集了“世界树之种”，“始源之水”，唯独缺了“蕴风之土”。本意是在第七季度《30岁》中，重塑世界树，因为篇幅原因，会在后期的剧场版放出。
第一季中暗藏了一个支线，如果有意便可发现。在第八章：流云茶间，他们遇到了说书人，自此远航便获得了与“紫金科技帝国首领”见面的机会。因为是一整个科技帝国，其首领自然就是留在最中心的人工智能，“他”管理着整个城市。
同时，引出第二剧场版：“人，神，以及动物”，这是唯一一章剧场版以连接上一章故事的形式出现。故事的开始便留下了伏笔，远航的时间在此刻上锁。故事简述了不同物种，不同生命，在经历着的不同生活与周期，或许神从未存在，但是每一种生命，都是一场旅途。故事结尾时，时间锁并没有解开，而远航已然在此时的真实世界死亡。
故事继续，远航依旧在房间醒来，一切都是那么的真实，而背后则是超级计算机推演着的未来。
后与伙伴玩了许久，主线剧情推进至魔羯座之旅，这是章独特的章节，旅程分为三个剧场版，第一章为：前剧场版讲的故事，（远航的不同人生，以及躲入月球，逃避地球的冰河时代），第二章讲述的是：远航读取章玥玥的记忆（她曾经历过的事，以及她为旧人类的故事），第三章讲述的是：玥玥离开后，远航听到了其绯色丑闻，并处理完发现是乌龙的故事。故事额外提到了玥玥现在的情况，因为远航借用虚拟的形式再次见到了她，告诉了她事情的原委，其实远航自己也没想过能再见。
魔羯座同第二季度：PVP（后更名为扩展模式），一起结束。
第三季度与第四季度并为（血色天空），前季度引出了世界树之战，其实是因为在异世界时空下，紫金科技帝国已经掌控了精灵国度以及世界树，所以精灵王族们召集了所有的人来围攻其统治，避免外族人控制了世界树，从而控制他们所有人。但是文章讲述的正面，所有黑暗面并不直接。但是结果也如预期，紫金的首领“他”，所挑选的远航赢下了这场战斗。
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