兵营的纳米核心早就已经在各个舰船的一些人迹罕至的舱室展开了，从兵营里出来的工程师更是在新伊甸夺取人类帝国派系舰队控制权的时候就立刻献祭自己，将自己的灵魂和意志上传到了舰船的沉思者阵列里彻底取代了舰船内的机魂。反对派的一切指令都被无视，工程师开始指挥舰上的机仆、伺服颅骨甚至是强行控制一些改造程度太高的机油佬和护教军对反抗最为激烈的反对派展开了最为血腥残忍的清洗和镇压。
与此同时科斯克的钢铁之环和星球上的联合舰队控制下的铸造圣殿等设施也同样被工程师顺利夺取控制权，整个联合舰队改旗换帜的速度甚至连禁军都觉得不可思议。
那些被工程师占领的舰船如果通过《红警》系统的操作面板进行观看，甚至可以看到它们上方都悬浮着一个扳手图案，这自然就是表示它们都在自动修复了。
很多服役超过百年乃至千年的老古董的下层甲板里那些因为年久失修而时常散发异味的通风管道里的异味渐渐消失，因为维修技术失传而发生泄露事故的核反应堆、等离子反应堆也开始渐渐自动修复自己破损的部位，泄露出来的危险物也消失不见。
中层甲板和下层甲板因为长期维护不足而时常出现氧气浓度不足或者是重力发生器失灵的事故的各种仪器的故障也彻底消失，一些不管机油佬磕多少大头，也始终亮起黄色灯光甚至是红色灯光并且时常出现蜂鸣或者是警报的设备也不再发出代表故障或者危险的蜂鸣和警报，黄色和红色灯光也重新变成了绿色。
再加上已经被惠东控制的钢铁之环提供的维护功能，不少带伤上阵的舰船的状态都好了不少。
事实上类似的事，也同样发生在了长寿星所在的星系，那里的人类帝国派系舰队也同样很快就被惠东的《红警》单位接管控制。
之后惠东又特意抽出一些时间，对人类帝国派系舰队里的那些不把底层船员当人看的虫豸统一进行了公审，而这次公审惠东甚至特意邀请了那些跟随联合舰队远征的阿斯塔特战团的代表以及寂静修女和禁军。
对于这些虫豸的审判联合舰队在科斯克和长寿星足足进行了一星期，涉及到的人员足足占到了人类帝国派系舰队里的指挥层的三分之二！
情节严重和恶劣的，惠东当场就宣布了这帮虫豸的死刑；剩下的那些最幸运的也是剥夺一切权利和身份，直接将他们填入了地面的铸造圣殿，让他们体验全年无休一天工作15泰拉标准时的辛勤劳动去了；而那些不幸的，只要禁军或者阿斯塔特战团代表不发话，那惠东就直接宣布将他们改成机仆，让他们用自己的身体趟雷去了。
至于那帮虫豸对惠东的咒骂，以及那帮虫豸的各种啼笑皆非的表现，惠东这一千多年里已经看的够多的了，他们这不是知道害怕了，他们这是知道自己好日子到头了。不过，这一切也都是他们自找的，人类帝国一万年的历史都没能教会这帮虫豸水能载舟亦能覆舟的道理，既然如此，那就让惠东带人用刀和枪好好给他们上一课好了！
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