紧接着，李明远又开始整顿军饷。军饷问题，是困扰明军多年的顽疾。由于朝廷财政困难，军饷常常被克扣，导致将士们军心涣散，战斗力低下。李明远知道，要想让将士们卖命，就必须解决军饷问题。
他一方面上书崇祯帝，请求朝廷尽快拨付拖欠的军饷；另一方面，他又在陕西境内推行了一系列的改革措施，增加财政收入。他严厉打击地方豪强和贪官污吏，没收他们的财产充作军饷；他鼓励农民开垦荒地，减免赋税，增加粮食产量；他还整顿了陕西的盐铁专卖制度，增加了盐铁的税收。
经过一个多月的努力，军饷问题终于得到了初步的解决。李明远按时足额地向将士们发放了军饷，还为将士们改善了伙食。将士们的积极性被充分调动起来，军心也逐渐稳定下来。
解决了军纪和军饷问题后，李明远开始着手补充兵员和粮草器械。他在陕西境内发布招募令，招募青壮年参军。由于孙传庭在陕西的威望很高，加上李明远推出的优厚待遇，很快就招募到了三万多名青壮年。
这些新兵大多是贫苦农民，身体素质不错，但缺乏军事训练。李明远将这些新兵编组成新的部队，由高杰等经验丰富的将领负责训练。他还根据自己对现代军事知识的了解，对秦军的训练方法进行了改进，增加了队列训练、体能训练和协同作战训练的比重，提高了军队的整体战斗力。
在补充粮草器械方面，李明远也是下足了功夫。他派人到陕西各地征集粮食，在西安、潼关等战略要地修建了大型的粮仓，储存了足够大军使用半年的粮食。同时，他还整顿了陕西的兵工厂，增加了火器和铠甲的生产。他还根据历史记载，提前派人到商洛山附近打探李自成的动向，收集情报。
时间一天天过去，三个月的期限越来越近。经过李明远的精心整顿，秦军的面貌焕然一新。将士们士气高昂，军纪严明，战斗力得到了极大的提升。粮草器械也准备得十分充足，已经具备了出战的条件。
这一天，李明远召集所有将领在校场集合。他骑着一匹高大的战马，穿着一身崭新的铠甲，威风凛凛地站在点将台上。
“将士们！”李明远的声音洪亮而有力，传遍了整个校场，“三年前，我们秦军威震天下，击败了高迎祥，打垮了李自成。三年后，闯贼卷土重来，作乱河南，残害百姓，践踏大明的疆土。现在，陛下给了我们平叛的重任，我们肩负着天下苍生的希望。我命令你们，三天后，全军出发，进军商洛山，讨伐闯贼！不灭闯贼，誓不还师！”
“不灭闯贼，誓不还师！”
三万多名秦军将士齐声呐喊，声音震天动地，响彻云霄。他们的眼中闪烁着坚定的光芒，充满了对胜利的渴望。
李明远看着台下士气高昂的将士们，心中充满了信心。他知道，这一次，他一定能够改变历史，击败李自成，为大明续命。
三天后，秦军主力在西安城外集结完毕，浩浩荡荡地向商洛山进发。李明远骑着战马，走在队伍的最前面，目光坚定地望向远方。他知道，一场恶战，即将开始。
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