震慑佛门后，嬴政加快了扩张步伐。他将万灵卫扩编至五万人，分为十个军团，除了原有的墨尘、白素贞、赵衍、老龙王和黑风谷降将统领部分军团外，又选拔了数位在战斗中表现出色的将领，分别负责山地、平原、城池攻防等不同作战任务。每个军团都配备了融合五行、时空法则的特制军械：能引动天雷的 “惊雷弩”、可布下迷阵的 “幻雾弹”、蕴含生命法则的疗伤丹药，这些装备让万灵卫在战场上所向披靡。
在收服朝廷直属的 “清溪城” 时，嬴政展现了他帝王心术的精妙。清溪城主原本效忠朝廷，对万灵卫充满敌意。嬴政并未强攻，而是先派商队低价供应粮食，解决城中饥荒；再让赵衍带人治愈城主重病的女儿；最后亲率百人卫队入城谈判，在城主府前展露金仙威压，同时许诺保留其城主之位，只需纳入大秦版图，缴纳赋税，并且派遣官员协助管理城中事务，传播大秦的文化与政令。
三管齐下，清溪城主最终开城投降。嬴政入城后第一件事便是颁布《大秦律?天下版》，明确规定 “人妖平等，犯法同罪”，同时开设学堂传授大秦文字，建立市集促进商贸，还设立了驿站，加强与周边地区的联系。不到半月，原本萧条的清溪城便焕发生机，百姓沿街跪拜，高呼 “秦王万岁”，周边城池见状，也纷纷派遣使者前来洽谈归附之事。
佛门控制的 “佛光城” 成为下一个目标。这座城池被金山寺经营多年，城中遍布佛寺，百姓皆受佛法洗脑，对妖族极端排斥。法海更是在此布下 “万佛阵”，号称固若金汤。
战前会议上，墨尘忧心忡忡：“陛下，佛光城守军虽只有五千，但万佛阵引动全城信仰之力，防御极强，强攻恐伤亡惨重。”
嬴政却胸有成竹：“信仰之力虽强，却也最怕人心离散。墨尘率主力在城外列阵，吸引敌军注意力；白素贞带水族潜入城中水井，污染水源（非毒，仅让水带有微弱妖气）；老龙王派人伪装成难民，散布‘佛祖不灵’的流言；我亲自潜入城中，找到阵眼所在。同时，派使者前往周边受佛门压迫的势力处，许以重利，邀他们在佛光城受攻时起兵响应，断佛门的后援。”
行动按计划展开。当城中百姓发现井水突然泛着妖气，又听闻周边城镇归顺大秦后生活变好的消息，原本坚定的信仰开始动摇。万佛阵的光芒随之减弱，法海察觉不对时，嬴政已潜入城主府下的密室，用时空法则冻结了阵眼的佛元珠。
“破阵！” 随着嬴政一声令下，城外的万灵卫发动总攻。失去阵眼支撑的万佛阵瞬间崩溃，佛光城守军溃不成军。法海见状不妙，带着残部逃回金山寺，佛光城宣告沦陷。
占领佛光城后，嬴政并未毁坏佛寺，而是将其改为 “万灵殿”，供奉人、妖、仙、佛各族先贤，宣扬 “道法自然，万灵平等” 的理念。同时，他派遣官员安抚百姓，减免赋税，开设工坊，让百姓有事可做，生活安定。这种恩威并施的做法，让城中百姓逐渐接受了大秦的统治，甚至有不少人主动加入万灵卫，希望能在大秦的庇护下，过上更好的生活。
短短半年，大秦的旗帜已插遍江南、中原部分地区以及周边诸多城镇。嬴政在临安城设立 “大秦天下都护府”，自任都护，下设民政、军事、法务、外交、农桑等五司，分管各项事务。他颁布的新律法规定：修士不得欺压凡人，妖类需登记在册，佛门不得干预政务，所有居民无论种族身份，都需缴纳赋税和服兵役，同时享有平等的权利和保护。并且鼓励通商，修建道路，促进各地之间的交流与融合。
为了巩固统治，嬴政大力推行文化融合。他让墨尘根据大秦文字改良出适合白蛇世界的文字，在各地开设 “大秦学堂”，教授文字、算术和基础修炼法门；让赵衍融合两界医术，编纂《大秦医典》，在城乡设立医馆；亲自提笔撰写《万法归一论》，阐述多法则融合的修行之道，供修士研习；还组织学者整理各地的风俗、传说，将其融入大秦文化，形成一种包容多元的新文化体系。
这些举措极大地促进了社会稳定。原本相互敌视的人妖两族开始和平共处，凡人也能通过修炼提升实力，佛门虽心有不甘，却因失去民心和城池，无力与大秦抗衡。金山寺被万灵卫团团围住，法海数次派人突围求援，都被时空法则布下的结界挡回，成了瓮中之鳖。
在收服江南最后一座妖族据点 “青丘岭” 时，嬴政遭遇了意想不到的阻力。青丘狐族实力强大，族长是一位活了千年的九尾天狐（金仙初期），不愿臣服于人族统治。双方在岭下展开激战，九尾天狐的幻术连嬴政的时空法则都难以完全破解，万灵卫伤亡不小。
僵持之际，嬴政提出与九尾天狐单打独斗。在青丘岭之巅，两位金仙强者展开惊天动地的对决。九尾天狐的幻术引动因果法则，制造出无数幻象；嬴政则运转时空、五行、兵戈等多种法则，时而化作金龙冲撞，时而布下五行大阵，时而以时空法则冻结对方行动。
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