然而，黑暗联军的实力远超想象。他们的战舰装备了新型的能量干扰器，使得联盟舰队的护盾和武器系统频繁失灵。局势变得异常危急，联盟舰队渐渐陷入了被动。
林默深知这样下去必败无疑，他立刻联系泽洛：“泽洛，我们遇到大麻烦了，敌人的干扰器让我们的装备无法正常发挥作用，你那边有没有办法破解？”
泽洛在研究室里紧张地忙碌着，他一边盯着各种仪器，一边快速敲击键盘：“我正在分析干扰器的频率，应该很快就能找到破解方法。你们再坚持一下！”
就在联盟舰队苦苦支撑时，泽洛终于传来了好消息：“我找到破解频率了！我会把程序发送到你们的战舰系统中，启动后可以抵御干扰。”
林默立刻下令所有战舰启动破解程序。果然，战舰的护盾和武器系统恢复了正常，联盟舰队士气大振，开始展开反击。在激烈的战斗中，林默发现了黑暗联军舰队的指挥旗舰，他决定亲自带领一支突击小队，直捣黄龙。
林默、艾莉丝和卡修斯带领着突击小队，驾驶着小型战机，突破了敌人的重重防御，成功登上了指挥旗舰。墨忒斯早已在旗舰上设下重重陷阱，等待着他们的到来。一场惊心动魄的近身战斗在旗舰内部展开，林默等人与墨忒斯的爪牙们展开了殊死搏斗。
林默凭借起源结晶的力量，一路过关斩将，终于找到了墨忒斯。墨忒斯站在巨大的指挥台前，脸上露出狰狞的笑容：“林默，你以为你能阻止我吗？今天就是你的死期！”
林默毫不畏惧，拔出剑来：“墨忒斯，你的阴谋不会得逞。今天，就是暗影议会覆灭的日子！”
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