数位可以使用仙术的强者，实力夸张的新生代，纷纷挺身而出。
其中，第五代火影波风水门之子波风鸣人，与宇智波新的天才宇智波佑助，在战斗中突然觉醒了强大的阳之力与阴之力。
这两种力量相互配合，波风鸣人与宇智波佑助凭借着这股力量，成功地将大筒木浦式封印。经此一役，忍界终于迎来了真正的和平时代。
而那穿越时空的道具“犂”，在战斗结束后，落入了退位的大蛇丸之手。
大蛇丸，这个向来对未知力量充满好奇的忍者，在战胜大筒木浦式之后，前往风之国交流。
在风之国，他利用龙脉之力和“犂”，成功穿越到了海贼王世界。
商启当年就是因为这穿越世界的时空之力，还有贝加庞克的加速机器，被传送到了6年后。
大蛇丸在穿越到海贼王世界后，遭遇了前所未有的困境。
他体内的查克拉无法补充，在茫茫大海上，差点沉入海水之中。
为了重新使用忍术，他加入了血统因子的研究。
在研究过程中，他提取了露娜利亚族的血统因子，还有一缕母火种，对自己的身体进行了改造。
经过改造，他终于能够借用母火种施展忍术，连移植的轮回眼和写轮眼也能够正常使用。
他轮回眼的能力是饿鬼道的吸收能量，所以自我改造之后，大蛇丸能够自由吸收能量，在体内生成母火种。
因为穿越过来的身体是女性，所以他现在被称为大蛇姬，但他还是喜欢别人叫他大蛇丸。
同时在大蛇姬的记忆之中，日向日足虽然被杀，但日向一族又出了一个宗家的日向雏田，她对波风鸣人十分迷恋。
日向一族也不是只有木叶忍村有了而在风之国砂忍村，还有一支特殊的日向一族。
他们是当年被商启在战场上俘虏的日向宗家，被三代风影裂磁拉去配种，繁衍出的砂忍日向一族。
这支日向一族，不同于木叶日向一族只练柔拳，他们更偏向于医疗与勘测矿产。
也正是因为他们的存在，当木叶忍村与砂忍村有矛盾的时候，木叶村都不敢轻易调动日向一族分家。
因为砂忍日向一族也学会了笼中鸟的控制咒印，还有设下笼中鸟之后的弱点，这样使得木叶日向一族逐渐放弃了笼中鸟这一术咒。
至于那个宇智波佑助，他是宇智波富岳的堂弟之子。
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