这下事情大发了，两只穆托想要汇合繁殖后代，而且经过测算，雌雄两只穆托会在一座沿海城市汇合，雄性穆托后面跟着哥斯拉和神秘巨龙，一旦这四只巨兽汇聚开始大战，指挥室里除了洛亚的其他人光是想一想，血压蹭的一下就上去了。
指挥室里的人全部开动，思考解决办法。最后军方决定，使用超大当量的核弹，引诱两只穆托，间接引诱哥斯拉和神秘巨龙 ，让四只巨兽汇聚在海上无人区，最后引爆核弹杀死四只巨兽。
计划开始，前期核弹头顺利装上船，但是转眼核弹头就被雄性穆托截胡，带到了沿海城市中心，成了给雌性穆托的见面礼。穆托有了核弹头，就开始筑巢产卵。
很快，洛亚就赶到了穆托巢穴，哥斯拉紧随其后，一场巨兽间的大战一触即发。
洛亚一声怒吼，率先发难，朝着体型较小会飞的雄性穆托发起进攻。一记利爪抓在了雄性穆托的头颅，可惜雄性穆托的头颅包裹着甲壳，这一下没有造成严重伤害。接着洛亚和雄性穆托同时起飞展开空战。两兽在空中激战，时而远离，时而靠近竭尽所能的用利爪和肢体给对方造成伤害。
另一边，哥斯拉和雌性穆托也开始交锋。护巢心切的雌性穆托挥动两对前肢，朝着哥斯拉出击，将哥斯拉打的一趔趄，但没对哥斯拉造成伤害。哥斯拉反手掀开雌性穆托，对雌穆托来了一记铁山靠，将穆托撞到了大楼上。穆托仗着皮糙肉厚，坚持着爬起来继续和哥斯拉展开战斗。
在巨兽们混战时，人类也没有闲着，组织了士兵潜入穆托巢穴取走核弹，其中一个士兵临走前点燃了汽车油箱里的汽油，烧毁了穆托巢穴里的卵。
感应到巢穴出事，雌穆托无心恋战，赶回巢穴，发现所有的卵都被毁了，恼怒的雌穆托将目光投向烧毁了自己巢穴的人类。就在这时候，浓雾里一道蓝光亮起，接着蓝光迅速蔓延，仔细一看蓝光竟是从哥斯拉的尾巴末梢开始亮起，逐渐向头部蔓延，当哥斯拉背部的蓝光达到最亮时，哥斯拉张开嘴巴，向着雌穆托喷出了带有高温的蓝色光束——原子吐息。原子吐息威力惊人，一击就把雌穆托重伤。
天上，洛亚身体里的能量回路逐渐免疫了穆托的电磁脉冲干扰，洛亚挣脱了雄穆托的缠斗，一记雷火加持的能量射线打断了雄穆托的翅膀，失去了一只翅膀的雄穆托瞬间失去平衡，挣扎着掉下天空，正好砸在雌穆托身上，将它们砸晕。从空中落下的洛亚，很快与哥斯拉对上了。
哥斯拉率先发难，朝着洛亚扑去，洛亚丝毫不惧，侧身一躲反手利用尾巴把哥斯拉相对短小精悍的前肢缠在哥斯拉身上，分布在尾巴末梢上的尖刺扎进哥斯拉的皮肤。同时洛亚身体里的能量回路开始发力，一记强悍的雷电在哥斯拉身上爆发，顺着洛亚尾巴上的刺进入哥斯拉体内。哥斯拉坚持了几分钟后，终于不支，被电晕倒地。
放倒了哥斯拉，洛亚收回尾巴，迈动脚步来到雌雄穆托面前，腹部裂开显露出里面没有尽头的黑暗，从黑暗里面伸出几十条触手，将两只穆托拉扯着，吞了进去，完事后腹部合拢，体型没有丝毫改变，这是洛亚通过对时空之力和吞噬之力的研究，在自己体内开辟的吞噬空间。有了吞噬空间，洛亚可以把体型巨大的存在储存起来慢慢吞噬消化，洛亚起飞返回骷髅岛，开始消化两只穆托的基因和器官。
第二天，哥斯拉从昏迷中醒来，发现穆托和洛亚没有了踪迹，便心情不好的仰天怒吼，然后返回大海，从人类眼前消失。
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