要等到100年以后了，随后郝先生就消失了，此时好基友打来电话，得知幽灵正在赶来路上。
为了不被发现擅自离家，斯科特也必须立刻回家，小可爱足够聪明机智调查局的人让斯科特赶了回去，差点惊掉了那帮调查员的眼睛，只能认为是情报错误。
就发现自己早就被团团包围，布利亚不得不被压进车内，可他们的实验室还是被幽灵抢走，被带进审讯室的两人因为大亮提前准备了可以解开手铐的发卡，他们顺利脱困，就在两人打算用缩小飞镖把墙锁上后逃出去的时候，斯科特派来蚂蚁军团送来了东西。
堂而皇之的从里面走了出来，在非遗大厅的引路下，他们一路寻着箭头寻找实验室，很快就追踪到了幽灵这边。
此时的幽灵正打算开启量子通道，却被蚂蚁给阻止幽灵冲过去寻找斯哥特苹果博士则用巨型蚂蚁困住，黑哥穿上战服的他亲自去量子领域解救媳妇，丁文博是成功进入后，在众人的默契配合下，他们重新夺回了实验室。
大亮带着好朋友感受一把什么叫速度，但是老板派来的人统统都被整得人仰马翻的大亮利用战俘上的能量波下，把摩托车变小一下，把玩具变大，可算是好好的大开眼界了一番，所以这幽灵却在此时现身实验室又被他给抢走斯科特和大亮为了抢回实验室，在车上是没少跟幽灵纠缠，身穿半成品的斯科特更是忽然变大一拳头，砸碎了幽灵的面罩，扭打中实验室却被身后一直尾随的黑色老板疑问。
货车当滑板车一路追过去，这时候的他可不怕什么通通敞开，一脚就将老板结果因为体型过大，只能看着老板抱着实验室逃走，被无数摄像头拍摄了，斯科特无奈的发现了老板坐上游轮好不容易变成与人大笑，可他的坐骑却还没来得及到他身边，就沦为了海鸥的食物，好不容易飞出来一个家伙，最后还是被海鸥给吃了，斯科特只能东的一声一阵浪花翻腾，巨型的斯科特忽然就从海水中冒了出来，就是放在岛国绝对就是新品种了，不费吹灰之力，斯科特抢到了实验室，结果身体因为变得实在太大吃不消。
但斯科特的大亮，这样好既有保护实验室，这还是被时刻警觉的幽灵抢先实验室瞬间被放大，与此同时在量子领域差点陷入一时混乱的终于见到了30年未见的媳妇，好先生老两口正好趁此机会开始往回赶，经过努力终于修复好了斯科特腰上的控制器，让人有惊无险地从海水中逃了出来，但是进入到实验室里的幽灵，开始吸收量子能量，正在往回赶的好心人的身体顿时出现异常，索性斯科特和大亮及时赶了回来，阻止了一脸震撼的人。
“一看这蚂蚁黄蜂又来了，幽灵那是气到不行，就在三人站的时候，博士总算带着心姐回来了，这一家4口都穿着战服，真的是帅到不行。”
善良的好先生将自己体内的量子能量全给了他，治好了他的病，短暂的温馨过后，警察已经赶来，斯科特将人变成巨吸引了大部分的人。
而自己则偷偷跑走，战俘逐渐变小的同时，实验室也变小了，光速赶回斯科特家时，见到的却是这幅场景，斯科特终于还是顺利结束了软禁，带着大亮和小可爱看起了别出心裁的露天大影幕电影，老两口轻松住进了海边的大别墅，享受迟来的恩爱生活。
但斯科特再次进入迷你版量子通道，为幽灵收集量子能量时，突然就和外面三人失去了联系，时刻都有不知道的事，这时有个叫密码的人刚好就打了个墙纸，甚至研发出了一种战斗力极强的哨兵机器人，对全世界的变种人开始了清洗屠杀，因为对手是拥有各种能力的变种人，这帮机器人可以根据对手的超能力属性来选择战斗模式。
地球上为数不多的变种人被迫团结一致，就连长期以来都是相爱相杀的老万和教授都选择抱团取暖，面对众多开发的运动员小队只能被打的四处逃亡，因为他们中的猫可以穿越到过去，教授于是提出或许可以通过穿越来阻止哨兵机器人的研发，这样大家才可以从根本上解决危机，大家一致认为只有将这一计划扼杀在摇篮里，变种人才有活的机会，幻影猫表示自己最多可以将艺术品送回到一个月前，但长达50年的时间跨度被送回去的人的大脑会崩溃的，以往的狼叔想到自己能自我修复的能力主动提出，只有他可以承受这次的时光之旅，就是霸气光环又要开始照耀了教授，嘱咐梁叔那时候的自己以大不相同，然后说必须要让你清楚地自己相信他，并和他正在统一野兽的对手，一脸颓废的教授出来阻止了这场闹剧，此时的他因为和老外分道扬镳，而失去了双腿和从小一起长大的模型里，好不容易建立起的学校，只辉煌了一个学期，大多数老师和学生都被迫征入伍，失去寄托的教授并开始一蹶不振，并沉迷于用大量的血清来治疗脊椎，导致失去了自己读新的超能力。
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