联盟在经历了那场惊心动魄的实验室之战后，虽然成功阻止了神秘势力的可怕阴谋，但整个宇宙都沉浸在一种悲壮的氛围中。各个星球都在为牺牲的联盟成员举行悼念仪式，他们的英勇事迹在宇宙间传颂，成为了希望与勇气的象征。
林羽和幸存的联盟成员们身心俱疲，但他们没有时间休息。在临时的医疗基地中，伤员们正在接受紧急治疗。医疗人员们忙碌地穿梭其中，运用各种先进的医疗技术和能量治疗设备，试图挽救每一位伤员的生命。一些伤势过重的成员虽然生命垂危，但他们眼中依然闪烁着坚定的光芒，为自己能为宇宙和平做出贡献而感到自豪。
联盟总部此时一片忙碌景象。战略专家们正在重新评估神秘势力的威胁程度，他们分析从实验基地获取的资料，试图找出神秘势力其他可能的据点和行动计划。科研人员则对从实验室带回的生物兵器样本和神秘科技进行深入研究，希望能从中找到破解神秘势力力量的关键。他们在实验室中夜以继日地工作，各种仪器发出的光芒照亮了整个研究区域。
在对生物兵器样本的研究中，科学家们有了惊人的发现。这些生物兵器的基因融合技术虽然邪恶，但其中某些基因片段却显示出与宇宙中一些古老文明遗迹的联系。这一发现让联盟成员们意识到，神秘势力可能一直在挖掘古老文明的力量来为自己所用，他们的阴谋或许比想象中更加复杂和深远。
为了进一步探寻神秘势力的线索，联盟决定对这些与生物兵器基因相关的古老文明遗迹展开调查。林羽再次带领一支精英小队出发，这次他们的目标是一个位于星系边缘的古老遗迹。这个遗迹被一层神秘的能量场笼罩，周围的空间充满了不稳定的能量波动，仿佛在警告着外来者不要轻易靠近。
当他们接近遗迹时，战舰的探测设备受到严重干扰，导航系统也出现了错误。机械文明战士们手动操控战舰，小心翼翼地穿越能量波动区域。在这个过程中，战舰的护盾不断受到能量冲击，部分系统出现故障。但他们凭借着精湛的技术和顽强的意志，成功抵达遗迹入口。
遗迹入口处刻满了古老的符文和图案，这些符文散发着微弱的光芒，似乎在诉说着古老文明的故事。林羽尝试用神器解读这些符文，神器发出柔和的金光，与符文的光芒相互呼应。渐渐地，他们明白了进入遗迹的方法，但同时也察觉到了其中隐藏的危险。
进入遗迹后，他们发现这里是一个巨大的迷宫。墙壁上闪烁着奇异的能量光线，这些光线构成了复杂的图案，似乎是一种古老的导航指引，但又充满了迷惑性。联盟成员们小心翼翼地前进，每走一步都要提防可能出现的陷阱。
在迷宫中，他们遭遇了一些古老的防御机制。机械傀儡从墙壁中出现，这些傀儡由神秘的金属制成，表面刻满了符文，它们的攻击方式十分奇特。有的傀儡能发射出能量射线，有的则能释放出一种可以干扰联盟成员精神的波动。机械文明战士们利用机甲的灵活性与傀儡展开搏斗，他们用机甲的武器攻击傀儡的关键部位，但傀儡的金属材质异常坚硬，很难造成有效伤害。
冰雪星球战士们则用冰冻能量试图冻结傀儡，他们发现冰冻能量对傀儡有一定的抑制作用。当傀儡被冰冻后，它们的行动会变得迟缓，能量攻击也会减弱。气态巨行星成员们在一旁协助，他们用宇宙能量感知周围的环境，寻找迷宫的正确路径，同时干扰傀儡的能量供应。
林羽在与傀儡的战斗中，发现神器对这些古老防御机制有着特殊的作用。神器发出的金色光芒可以驱散傀儡释放的精神干扰波动，而且当神器与傀儡接触时，能使傀儡身上的符文暂时失去能量。林羽利用这一特点，带领联盟成员们逐步突破傀儡的防线，向着迷宫深处前进。
在迷宫的中心他们发现了一个巨大的能量核心。这个能量核心散发着强烈的光芒，周围环绕着复杂的能量管道和控制台。能量核心的表面刻满了与生物兵器基因中相似的符文，这进一步证实了这里与神秘势力的关联。
然而，当他们接近能量核心时，遗迹的防御机制再次升级。地面上出现了巨大的能量漩涡，这些漩涡释放出强大的吸力，试图将联盟成员们卷入其中。同时，墙壁上的能量光线汇聚成一道道能量束，朝着他们射来。联盟成员们陷入了危机之中。
机械文明战士们迅速将机甲的能量护盾开到最大，试图抵挡能量束的攻击，但护盾在能量束的持续冲击下开始出现裂痕。冰雪星球战士们用冰冻能量在周围制造出冰之壁垒，减少能量漩涡的吸力。气态巨行星成员们则努力寻找关闭能量核心防御机制的方法，他们在控制台周围寻找线索。
林羽感受到了巨大的压力，他知道必须尽快解决眼前的危机。他集中精神，与神器深度融合，神器爆发出耀眼的光芒。林羽借助神器的力量，朝着能量核心飞去，他要尝试从根源上关闭防御机制。在接近能量核心的过程中，他承受着巨大的能量冲击，但他凭借着顽强的意志和神器的力量，一步步靠近。
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