二十世纪美苏争霸制定出的星球计划真的寻找到外星人的存在，也引来了宇宙中的不速之客，导致地球被入侵陷入核战争，就是所谓天灾。天灾引起基因污染，人类大批死亡下，基因突变为短寿但繁殖力极强，也就是如今的短生者前身。
女主是天灾后专门繁育出研究人类出路的存在，在外星移民计划中，女主找到一种微生物，可以在与人类共存后改变人类的基因，让人类变成如今的圣血族，而圣血族又能将一部分短生者转变为红血族。
这项研究落入一些自私的人手中，他们觉得掌握这项科技，成为圣血族就能掌握整个人类，于是将女主囚禁，把控着技术控制着地球。
女主在朋友的帮助下逃出牢笼，公开技术，然后再次遭到逮捕，被秘密判处死刑并永远流放太空。
临死前她的朋友毁掉她的脑白质，抹除记忆，给她植入了一段没有核战的美梦。
然而女主作为第一批接触微生物的人类，因为当时技术不成熟，她转变成不同于圣血族和红血族的第三种存在，她并没有死去且一直在恢复，并在太空中飘荡了两千年，直到遇到男主将她唤醒。
在她死后，统治者用她的基因做了许多克隆人，在统治层担任吉祥物，以掩饰自己的罪行，也就是如今的女皇，她实际的权利被长老会架空。
然而因为留下的基因有缺陷，或者有反叛的心，克隆人每几十年就会自然死亡或者被处死，然后再克隆出来，继承前代没有问题的记忆。
女皇并不想当个玩偶，叛军和“迷失者”就是她控制的，她要推翻长老会，和所谓圣血族的帝国。
女主恢复记忆后，帮助叛军攻入帝国首都，杀死大部分统治者，然后遇到了领兵来抗的男主。
男主作为圣血族早已知道历史，他仰慕的一直是作为圣血族、红血族母亲的女主而不是女皇，知道她的选择后，当即投敌。
女皇在这次战争中重伤，死前表示自己不想再被克隆出来了，于是她迎来了真正的死亡。
女主和男主联手，推翻帝国，改为联邦，并且研究让短生者能活得更久的方法。
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