同年九月，御史台在蔡确的主导下，终于给出了结案报告：陈世儒夫妇被认定共同策划并实施了弑母罪行，依据大宋律法，两人应当处以极刑。
那时，宋神宗面对陈世儒一案，心中起了微妙的犹豫。毕竟，陈执中膝下仅此独子，倘若陈世儒身首异处，陈家便面临血脉断绝的境地。他思索着是否能网开一面，让陈世儒留下，延续陈家的祭祀香火，私下不禁提出：“只此一子，何不留他以保全家族祭祀呢？”
御史台的蔡确立场强硬，对于神宗的恻隐之心不以为然，厉声反问：“对于如此悖逆纲常伦理的滔天大罪，岂能轻易宽恕？”他的质问掷地有声，仿佛敲响了正义的钟鸣。
最后，铁面无私的判决落下，陈世儒夫妇及其参与谋杀的众多婢女共计十九人，悉数被判死刑；其他相关涉案者则被流放到边远之地。与此同时，因对此案处理失当、涉嫌包庇罪犯，开封府原负责官员遭受惩处；大理寺的法官们因借机扩大打击范围，亦未能逃脱责罚，其中大理寺丞贾种民更是因此被降职处分。而吕公着的儿子吕希绩、吕希纯，侄子吕希亚，以及司马光之子司马康、关联人物晏靖等旧党子弟，纷纷因卷入此案旋涡，受到贬谪的惩罚。
背后的真相却是，新党意图借助此案一举扳倒旧党两位核心人物吕公着和司马光，通过陈世儒案发动了一场针对旧党的全面攻势。幸运的是，这些旧党二代虽身处险境，却未曾屈服于压力，坚决扞卫父辈清誉，不曾构陷长辈。
这件看似普通的刑事案，因其背后错综复杂的党派斗争，逐渐发酵成为新旧两党激烈攻讦的战场。同一时期，还有另外两起类似案件，如同镜像般映射出朝廷内部的裂痕。自此，大宋朝廷的秩序开始暗潮涌动，渐趋瓦解。新旧两党为了各自利益，不惜一切代价互相倾轧，这无疑为日后宋朝的衰败乃至覆灭埋下了深深的祸根。
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