此时，五大门派开始联手压制明教，明教内部又因阳顶天的消失而陷入混乱，起义军很快被扑灭。
这场明教联合中原武林的第一次大规模起义，在元军的铁蹄下迅速被扑灭，教中弟子死伤惨重，血流成河。
杨逍等人面对这突如其来的惨败，只能带领剩余的弟子退守光明顶。
他们心中充满了痛苦和无奈，但也深知此时唯有坚守阵地，才能保留明教的一线生机。
他们希望来日能够复兴明教，重振旗鼓，再次与元军抗衡。
然而，明教的衰落并未就此止步。
在起义失败后，教内又陷入了教主之位的争夺战。
杨逍、韦一笑、五散人等人彼此不服，各持己见，教中内乱不断。
这场内乱让明教的实力进一步削弱，四分五裂的局面已经形成。
殷天正眼看明教陷入泥潭，深知自己无力回天，于是遵循郭复的嘱托，带领自己的人马前往江西，创立了天鹰教，希望另起炉灶，重振旗鼓。
如此一来，明教衰落到极点。
在明教的历史中，这段时期无疑是最为黑暗和混乱的。
曾经以正义和光明为信仰的明教弟子，在失去管教后如同失控的洪水，冲破了道德的堤坝。他们中的一部分人，在江湖上游荡，以明教的名义进行着各种恶行，烧杀抢掠，无所不为。
这些行为使得明教在民间的形象一落千丈，曾经受人尊敬的抗元先锋如今却成了民众口中的恶势力。
面对这种难以收拾的局面，明教内部也是一筹莫展，似乎已非人力所能扭转乾坤。
而且，当年杨惊天和郭念在朝廷各个阵营布下的暗哨，因为这场起义提前浮出水面。而现在明教大军草草收场，元庭不免察觉出异常，于是挥舞屠刀斩草除根。
明教右使范瑶纵使自认智勇双全，但亦是无计可施。不过他清楚地认识到，这种局面的形成并非偶然，定是有人在背后精心策划和操纵的。
为了找出这双黑手，再加上苦求黛绮丝不得，他早就心灰意冷，于是不惜自毁俊朗的容貌，扮成苦头陀，在大都杀害了几名明教香主，以此获得汝阳王的信任，并成为其座上宾。
某日，他见峨眉派的灭绝师太潜入汝阳王府，意图夺回倚天剑。
念及当年师父师娘有意撮合自己与她的旧情，范瑶并未将其拿下，反而冒着被发觉的风险，暗中将倚天剑送还于她。
汝阳王得知倚天剑被盗后，意识到武林中仍有不少抗元力量存在。
为了削弱这些势力，他心生一计，将当年从郭破虏手中夺得的屠龙刀送入江湖，并大肆宣扬“天下至尊，宝刀屠龙”的口号。
果然不出所料，江湖中人的名利心被勾起。
为了争夺屠龙刀，各大门派、各路英雄纷纷陷入纷争、自相残杀。
一时之间，江湖中再也没有像样的抗元力量存在。
元庭也就此稳坐钓鱼台，继续其对中原的残暴统治。
……
再说终南山上，那日，郭复带着阳顶天与柳芯茹的魂魄所依附的木剑，从光明顶缓缓归来。
阳顶天二人死去时日已久，尸身早无法再用。
郭复只能用着残存的神力，用泥土细心地塑造了两具身体，将阳顶天与柳芯茹的魂魄安置其中。
而后在重阳宫坤位布下法阵，将泥像放置其中。
郭复在前面七八年里，寸步不离终南山，因为需要每日口诵真言，祈愿杨破天杨惊天他们能够吸收日月之精华、天地之灵气，重回人间。
……
时光荏苒，大约过了六百年之久，阳顶天独自在重阳宫中醒来。
醒来的阳顶天已经忘记了很多事情，他只记得自己姓杨，而且曾有个小自己很多岁的妻子。
他带着这些残存的记忆，带着这副年轻的身体，以全新的身份回到人间。
阳顶天目睹了华夏大地再次遭受异族入侵的惨状，他的心中涌起了强烈的报国之志。
他明白，在这个日新月异的时代，单凭个人的勇武已无法与现代的科技力量相抗衡。为了实现自己的理想，他选择了一条与众不同的道路。
于是，阳顶天改名不换姓，以“杨博士”的全新身份，投身于现代科技的研究之中。他深知，只有掌握先进的科技知识，才能为国家的繁荣富强贡献自己的力量。
后来更是毅然决然地踏上了漂洋过海的旅程，去往那遥远的国度，攻研物理学，为国家的未来贡献自己的力量。
在异国他乡，他刻苦钻研深入分析乾坤大挪移，发现了极其符合测不准原理，悟出了量子力学的奥秘；还有通过观察九阳神功的真气波动，深刻感受到能量守恒定律。
他勤奋不辍，最终获得了无数的荣誉和成就，成为了物理学界的佼佼者。
后来，他带着自己的知识和技术回国报效祖国，被传为美谈。
然而尽管身边围绕着众多仰慕者和追求者，阳顶天却始终是孤身一人，未曾结婚。
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