女真海盗在很长时间中，一直在海上从事打家劫舍的事业，即使是后来的完颜阿骨打带领女真人建立了金朝，仍然有不少人选择投身海上去做海盗。但是随着蒙古人的崛起，金国灭亡，女真人成了蒙古人的附庸，而这些传统海盗皆受到了沉重打击，一时间一蹶不振。
元朝初年确实有一段海军强盛的时期。由于与南宋的作战以及灭宋过程中吸纳了南宋归附的水军，元朝继承了南宋王朝的海军优势。蒙古对高丽武家政权的打击，以及随后两次征日行动，对高丽沿海地区豪强势力带来了极大的伤害，因此这些地头蛇们无力再继续投资海盗活动。
不过海盗并没有因此而绝迹，只是转入了低潮，而蒙古人的战争又使另一股海盗随之崛起。元王朝对日战争使得本来就已经走向衰落的镰仓幕府财政破产，陷入南北朝时代，大量武士沦为恶党和浪人，他们出海集结成大批的倭寇，袭扰元朝沿海。大规模的倭寇活动，开始正式在亚洲历史上出现。
这些倭寇对高丽沿海地区的熟悉，收编了被高丽沿海豪强们抛弃的海盗势力，至此着名的倭寇开始露出了他们的獠牙与魔爪。照理说，元朝既然继承了宋朝的水军优势，应当能够有效惩治这些倭寇吧？并没有！由于元王朝长期处于财政入不敷出的状态，水军在与赵昺率领的大宋水军战斗中屡战屡败，加之征讨安南、占城的战争损失惨重，是蒙元无法再重新打造一支强大的海上力量，只能任由倭寇来去自由。
倭寇的袭击既见于闽浙，也见于江苏、山东、河北、辽宁等地，覆盖整个元王朝沿海，高丽连年都会发生倭寇入侵事件。入侵的倭船少者五十余艘，多者则达二百余艘，每到高丽一地，则庐舍尽焚。而漕船也成为倭寇掳掠的主要目标，迫使高丽王朝最后改漕运为陆运。
面对猖獗的倭寇，蒙元别说当下无力清剿，估计还会觉得挺有用处，甚至会暗中支持。海盗的骚扰让占领江南的宋朝水军，不得不在信风季派遣战船保护海上贸易线，为商船护航，从而牵制了宋军的兵力，无法通过海上行动对自己内陆腹地采取军事行动。且他们过去一直重视海贸，如今航线皆被宋军控制，导致自己无法参与其中，自然更乐于见到海盗们加大对宋朝的侵犯，破坏江南沿海的经济……
对于盗匪这个古老的职业，赵昺深知其具有顽强的生命力，从古至今就如跗骨之蛆一般伴随着人类历史，反正在他穿越来的年代还依然存在，恐怕还会继续存在到人类消亡。而其的危害性毋容置疑，小的能引发百姓的恐慌，造成社会的不安，财产的损失；若是做大，则可以颠覆一个主权国家，给区域经济造成损害，甚至危害到国际的安全和经济发展。
那么盗匪的危害性早已为世人共知，那么为何生命力如此顽强呢？答案也很简单，主要原因就是天灾人祸交加，逼得人们吃不上饭，这才相聚为盗干没本儿的买卖。而赵昺自知没有本事解放全人类，实现世界大同，满足每一个人的需求，建立一个‘路不拾遗，夜不闭户’的社会，结果就是他无法完全消除匪患，完成这个前无古人后无来者的宏大愿望。
既如此赵昺只能退而求其次，尽力保证自己的一亩三分地儿上少受盗匪的侵扰。而要做到这点，他依然觉得是个任重道远的任务，且相当让人头疼。可这件事情又不能不做，盗匪频繁侵袭必然会造成百姓的恐慌，攻州掠府杀死官员也是挑战一个主权国家的底线，而他们在海上贸易线劫掠商船，更是威胁到大宋的经济命脉，他无论如何也不能容忍。
对于剿匪，赵昺还是有一些经验的，且自己也曾想入行来着。当年他初入琼州，就面临着严重的匪患，他采用招抚并用的方法剿灭了盘踞在琼州周围的海匪，收服了兵匪合一的俚民，从而消灭了横行琼州附近海域的海盗。
此后随着宋军的壮大，水军更是强盛的不像话，连蒙元水军都躲着走，海盗们更是望风而逃远避琼州。而赵昺还活学活用，转而利用海盗匪寇和形同盗匪的盐枭骚扰蒙元占据的闽广地区，逐步将他们收为己用，终发展成为一支可与元军抗衡的力量，在收复江南的战争中发挥了极大的作用，并被编入宋军正规军序列。
进入江南后，赵昺要靠海贸挣钱，对海盗的打击更是不遗余力，将东南沿海的海盗远逐，并以水师进行护航开辟新航道，可以说海盗们见到无不远比。但是此次盗匪袭击海州，使他发现盗匪们并不愿意放弃这块肥肉，利用两国交战的时机要从中分一杯羹。而更让赵昺担心的是盗匪们已经有了合流的趋势，并尝试相互配合作战。
要知道一盘散沙般的匪寇，远比一支抱团的亡命徒要难对付。小股的盗匪也只敢做些劫道、绑票、敲诈勒索之类的小案子。而一旦几股匪寇联合起来，他们胆子也就壮了，能够占山为王，攻打防守薄弱的州县，抢劫仓廪，劫掠人口。若是不能及时剿灭，实力也会随之壮大，进而形成割据力量。
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