两日后，董卓指使皇宫侍卫对在万安宫中的何太后下毒，使其中毒身亡。董卓霸道的不允许朝廷为何太后举办丧礼，而是让刘协到洛阳城内奉常亭表示哀悼，公卿大臣们穿白衣上朝三天。随后没过多久天弘农传来刘辩身死的消息，实际上又是董卓的手笔，他派手下谋士李儒在刘辩府中灌毒酒将其毒死。随着何进何苗何太后相继死亡，东汉最后一个外戚专权的势力彻底烟消云散。东汉虽然没有了宦官、外戚，但军阀林立，东汉犹如风烛残年的老人，浑身毛病，离寿终正寝不远矣。
董卓初入朝延急需得各阶层的认可，首先遥封远在幽州的幽州牧刘虞为大司马，董卓由司空改任太尉，兼领前将军，加节，赐斧钺、虎贲，更封郿侯。政治上，董卓为第二次党锢之祸”中被捕遇害的众多党人平反，为被诬陷为叛贼的陈蕃、窦武沉冤昭雪、恢复名誉。恢复所有无辜被害人的爵位，并提拔他们的子孙为官。任人选官方面，董卓亲近士人，征召名士入朝为官，授予黄琬司徒、杨彪司空、马日磾司马缓和朝廷老臣对他看法，又选拔大量名士韩馥、刘岱、孔伷、张咨、孔融、应劭、张邈担任地方太守，甚至不计前嫌，对厌恶自己而弃官而走的袁绍、王匡、鲍信等人授以太守，以示和解。可谓是用心良苦，终是无法掩盖其豺狼本性。
董卓性格残忍，乱用刑法立威。往往借题发挥将得罪自己，以前看不起自己或者自己厌恶的人要么活活将其乱棍打死，要么中途劫杀。董卓趁着何太后遗体下葬的时候，开启文陵（汉灵帝陵墓）时，让人偷取其中珍宝。董卓放松对手下兵士的约束，违反军纪、犯罪的士兵不予惩罚，放纵士兵在洛阳城内劫掠富户，搜刮财物，奸淫妇女。董卓自拜相国，有“入朝不趋，剑履上殿”的特权，又封自己的母亲为“池阳君”，设置令、丞，却杀害何后母亲“舞阳君”。自此董卓在朝廷中的权势已经如日中天。
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