《独步武林》的结构可以说是把游戏中的打斗教学机制和剧情给完美地融合在了一起。
拳馆可以看成是一个教学关，这里的结构比较简单，boss也相对较弱，侦探解谜环节也不复杂，主要是为了帮助玩家快速上手游戏的基础机制，适应玩法。
而到了夜店，游戏才正式开始。
从这一关开始，玩家要开始掌握腿法和步法，而且在打败谭子理以后，就可以根据现场更多的蛛丝马迹而进一步细化凶手的形象，并根据关键证物追踪到凶手在城中村的住处。
在这里，玩家可以展开进一步的调查，得知这个凶手有一条腿微跛，用了各种古法的训练方式，而且性格极端，是个名副其实的武疯子。
只不过对于他具体长什么样子，还是没有明确的概念。
紧接着，到了雕塑美术馆一战。
方泰来的这一关会引导玩家学习特定的擒拿、摔跤和地面技术，相较于之前的拳脚功夫，这些擒拿技术本身难度和威力又上了一个档次。
打赢这一关之后，又可以通过蛛丝马迹以及警方的调查，有了凶手大致的模糊画像，并指引到一个边缘的小县城中。
只是到了小县城中进行了简单的调查，却发现没有符合的人。把凶手的画像拿给县城中的人看，他们都说不认识。
此时玩家可以查到一个合影，在上面看到了封树。
刚开始警察还以为是小县城里的这些人在刻意地包庇凶手，但深入审问之后才发现，原来这些人是真的完全不认为凶手和封树是一个人。
两个人只是看起来长得有点像，但一来，警方的图像本来就是根据目击者的口述绘制的，凶手穿着连帽衫，目击者也没有看得太清楚，图像不一定特别准确；二来，众人也实在无法将那个人尽可欺的老实农村青年封树和绝世高手、杀人狂魔给联系起来。
所以，调查暂时陷入僵局。
玩家扮演的主角推测出了凶手的下一个目标就是疗养院的冯清辉，于是赶过去保护，却没想到还是晚了一步。不过这次成功看到了凶手的脸，确实就是封树。
习武成痴的武疯子形象，和那个沉默寡言的农村青年形象，两个形象在调查中逐渐靠拢、融合，各种片段不断地闪回，最终，凶手的形象呈现在玩家眼前。
而此时主角清楚地意识到，自己不是封树的对手。
于是游戏又进入了下一阶段：玩家需要在自己的脑补场景中，分别扮演赵怀恩、谭子理、方泰来和冯清辉，总结这些人失败的关键点，反推出对付封树的办法，打赢封树！
而后，才迎来与封树的最终对决。
(本章完)
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