同时开设三所学校。
南京军事大学，由郑克均亲自担任校长，由岳飞等将领，担任教习。
学员主要是军队中的中下层将领，以及有潜力的士兵。
主要教授如何统领装备热武器的近代化军队，如何指挥战斗营配合作战。
南京科技大学，由宋应星的次子宋士意担任校长，作坊熟练的工匠，以及大明皇家学会的科研员，担任教习。
主演培养技术工匠和科研人才。
同时开设南京师范大学，由王夫之担任校长，数学家方中通担任副校长。
李柏，李颙等经史大家以及皇家学会的会员担任教习。
主要培养语文、数学、物理、化学等方面的青年人才。
一方面可以进入皇家学会，一方面为将来开设中小学教学铺路。
宋应星长子宋士慧，担任皇家学会副会长，坐镇南京，同时掌管南京博物司。
在顾炎武、王夫之、黄宗羲等人联名举荐下，郑克均派遣使者到日本，准备迎回朱舜水，担任南京总经略。
朱舜水，不但是一代大儒，而且精通天文，地理，农业，建筑，医药。
以务实、力行，学以致用为宗旨。
历史上因为他的存在，日本江户幕府进行大面积革新，一举摆脱了积贫积弱之境。
是明治维新前，日本工农业最重要的先驱导师，没有之一。
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