轩辕以河图洛书在有熊氏祖地布下“混元河洛大阵”，将蚩尤大军齐齐卷入另一世界，蚩尤之兵卒无论在其中对有熊氏如何破坏，对外界亦无法影响分毫，轩辕借助阵法将其逐一击倒，最终只余蚩尤。
蚩尤本体并不如刑天般巨大，但同样亦可动用巫妖之力，力战轩辕不胜后，遂愤然将其激发，化为巨大漆黑野猪横冲直撞，将虚假有熊氏祖地撞得一片狼藉。
轩辕披发浴血，终将蚩尤击败，然其躯体同刑天一致，只可斩断，无法杀伤，轩辕遂将其分为五分，交由赶来支援有熊氏的诸部族分别镇压。
各部族欺轩辕年少，诸多刁难，阴奉阳违，更有暗中运作试图拼好蚩尤之人。
轩辕问青牛曰：“我分明以一人之力击败蚩尤，为何诸族竟不屑一顾？”
青牛答曰：“有巫妖之力类比，若无直观威胁，他们只可能以你的外表判断实力。”
轩辕明悟，遂以河图洛书修复并改造蚩尤氏遗留战船，培养有熊氏水手，最终获得百艘高速浮空战舰，诸跳脱部族方恢复沉默。
轩辕将这百艘战船以鸟为名，旗舰取名“寒鸦”，以之统一涿鹿之战外所有部族，并多次升空寻九天玄女，有战船相助，汹涌天河未能阻止轩辕，但轩辕亦始终未找到玄女。
此后，轩辕于每年玄女被带走之日驾战船升天寻找玄女，始终一无所得，并于炎帝出现后彻底停止。
炎帝者，为远离有熊氏及蚩尤、刑天等部族，西方诸部落之王，已能驯养马匹，训练骑士，手下精锐，皆不逊于刑天蚩尤。
其此次前来，乃是确认东方诸族是否已有统一首领，若无，或首领孱弱无能，则挥军东进。
炎帝曰：“我族绝不如刑天蚩尤般残暴，亦将尽力结束巫妖之战，若轩辕耽于寻找女子不欲为帝，我可代为治理。”
轩辕默，而后对曰：“我享土德，故号黄帝，炎帝请回。”，此语一出，天降功德，云霞璀璨，金光耀眼，炎帝遂退归西方。
自此，黄帝长居轩辕之丘，建都有熊，对鬼神信而不畏，于多处有鬼神传闻之山川，或封禅祈祷、或铸鼎以镇，对各部族一视同仁，每日听取臣子奏策，又举风后、力牧、常先、大鸿等贤人以治民。
借河图洛书之力，黄帝统合人族部落，强行制止巫妖大战，再获功德，巫族与妖族因实力大损而退向山海丛林，伺候极少出现。
经此一役，男子在武力、体力等方面之优势凸显，又有黄帝表率，男子在部落和家族中地位逐渐拔高。
巫妖之战平息数年后，黄帝娶西陵养蚕女为正妃，是为嫘祖，嫘祖生子女各一，其姐曰姬悦，其弟曰姬峰，继承帝位者为姬峰，令男子更受重视。
多年后，黄帝崩于轩辕之丘，葬轩辕坟，轩辕坟中修建有黄帝故里，格局摆设均按其生前故居原状，作等候某人归来之态。
轩辕坟之入口仅有一池塘、一青牛、一『毛』皮少年耳。
注：本文写成之前，有人言之凿凿称黄帝未死，而是在死前乘一条黄龙飞天而去，并指责本人所着历史有严重歪曲，且刻意夸大了玄女和黄帝的关系。
笔者必须指出，如果不是当真喜欢，哪位神仙会愿意在一个凡人身上浪费数年时光？至于那条黄龙，呵，即使是九天玄女亲自来接轩辕黄帝，也绝不可能用黄龙的形象，那岂不是自认是黄帝的子民？难道天上还有如此不在乎面皮的神仙？
最后，你们写文章攻击我之前，最好想清楚，你们用的字是谁发明的，不要自取其辱、仓门弄字。
——仓颉·《黄帝本纪》
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