当初，邹元标站在朝廷上，正直威严，令人生畏，晚年努力争取做到和睦平易。有人议论他赶不上刚开始做官的时候有气魄。
邹元标笑着说：“大臣跟言官是有区别的。风度超绝，是言官的事情。大臣关心的不是大的利益和损害，就是应当保护扶持国家，怎么能像年轻人那样怒形于色呢？”
这时结帮拉派十分兴盛，邹元标讨嫌这种做法，想改正这种陋习，所以他举荐引用的人不拘一格。曾经想推举任用李三才，因言路不通，邹元标没有坚持。
王德完讽刺他首鼠两端，邹元标也不计较，南京御史王允成等人以为他们二人有矛盾，请求朱由校下诏调解。
邹元标说：“我与王德完从来没有矛盾，这一定是有人在从中捣鬼。我曾跟朝中大臣说：‘当今皇帝年幼，敌人就在国门边上，只有同心协力、同舟共济了。倘使再党同伐异，对国家来说就是不忠，对家庭而言就是不孝。世上自有不偏袒、不结党的正道，为什么总是在窝里斗个没完呢？”
皇帝即位已经很久，但前朝被废黜、死亡的各臣还没有得到赠封照顾，邹元标多次上疏阐述抚恤大典，言辞更为恳切。
康熙帝立，不久改任吏部左侍郎。未到任，授官左都御史，可见朝野威望之盛。
泰昌元年冬，建奴进犯沈阳卫、土默特部进兵宣大，邹元标自清戎边，及至沈阳卫大捷传至，这老夫子当场载歌载舞，喜曰：“想不到这老骨头还能见此盛事，当浮一大白，为圣天子贺，为辽东将士贺。”
其时，内廷建议，熊、袁、米三人封伯，在廷议时韩爌、刘一燝、赵应星、杨涟、左光斗等反对，方从哲、叶向高不置可否，邹元标当场大骂：“鼠目寸光之辈，不足与谋也，朝廷行事，有功必重赏，有过必重罚，方能将士用命，万民信服，若有翦平建奴之日，就以国公之礼相待又何妨？”
夫子一旦支持，叫得最欢的东林党立即不敢再叫了，遂过廷议。
这样一位老夫子，侯国兴打了他，还不被天下人痛骂至死为止？打赢了丢脸，打输了则是白挨打。
田尔耕说明了这一节，侯国兴只好只叹晦气。
侯国兴道：“不拿下杨、左二贼，如何完成任务？”
田尔耕道：“咱们进都察院拿人，他们当然宁死不从，这是真正的打脸呢？如果在别的地方，这就容易多了。”
侯国兴道：“听说咱锦衣卫拿人，他们还不速速躲了起来？”
田尔耕道：“杨大洪、左遗直，何等心高气傲之人，他们是不会躲在公廨中不出的，大人可命校尉们埋伏在路上，一举拿下，大人应当回北镇抚司准备，准备一下怎么商量这几位贵客。”
侯国兴道：“米柱这小子，也忒坏了，他将北镇抚司搬空，一个有用的人也不留。”
田尔耕道：“米提督在河东办的可是大事，此事一了，他的圣眷无人能及。”
候国兴却是道：“老田，你信不信有人办皇差，会不上下其手，他为皇上弄来这么多金花银，自己截留的应该更多吧？”
田尔耕道：“断无可能。”
侯国兴讶道：“大人为何如此肯定？”
田尔耕道：“从米提督的诗可以看出，他的品格十分高尚，他为人志向远大，前程万里，兼且办事为人，深谋远虑，布局宏大，很有名士风采，又岂会为黄白之物而折腰？”
候国兴道：“你这老田，是不是绕着弯儿骂本官？”
田尔耕道：“不敢！米提督确是有令人折服的风采，品行高洁，他的敌人都会尊重他。”
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