李守仁一党的覆灭，如同在太医院这片看似平静的水面下引爆了一颗惊雷。余波荡漾，人心惶惶，却也涤荡了不少沉疴积弊。空出的职位，苏晚晚并未急于安插亲信，而是秉持“唯才是举”的原则，经与张明德等资深太医商议，并报请雍正批准后，提拔了几位医术精湛、风评甚佳且对新医理持开放态度的太医填补空缺。其中，张明德因在此次清查中表现出色，被擢升为副院判，辅佐苏晚晚处理日常事务。
这一系列举措，既稳定了局面，也向太医院众人昭示了新的规则——能力与德行，才是晋升之阶。
然而，苏晚晚深知，铲除贪腐只是第一步。太医院积弱已久，不仅在于人事，更在于僵化的制度和陈腐的观念。她的“医学研习馆”此前因阻力而进展缓慢，如今，障碍已除，正是大刀阔斧推行革新之时。
她重新修订了研习馆的章程，将其制度化、常态化。规定所有四十岁以下的太医，每月必须参与一定课时的学习，内容不仅包括她系统整理、绘制的更为精确的人体脏腑经络图谱、常见疾病诊疗新法，还增设了药材辨识、炮制，以及基础的急救、防疫知识。她甚至大胆地引入了一些简单的物理、化学（以这个时代能理解的方式阐述）原理，来解释某些药理和病理现象。
起初，仍有部分老成太医私下非议，认为此举“不务正业”、“有辱斯文”。但苏晚晚并不强求，只是将每次授课的内容整理成册，供人查阅，并以实际病例展示新法的优势。
机会很快到来。京郊一富户幼子，误吞一枚枣核，卡于喉间，面色青紫，命在旦夕。请了数位太医，皆因枣核位置太深，束手无策。家人绝望之际，听闻太医院苏院使或有奇法，连夜叩门求援。
苏晚晚赶到时，孩子已几近窒息。她迅速检查，判断枣核卡在了气管深处。若按古法，几乎无救。她立刻让人取来灯烛、铜镜（利用反光原理增加视野）、以及她让工匠特制的、前端带弯钩的细长银探针（灵感源于陈实功笔记中对某些外科工具的设想）。
在众人紧张的目光注视下，苏晚晚利用铜镜反射光线，看清了枣核位置，然后用银探针小心地勾住枣核边缘，一点点将其取出。整个过程不过一刻钟，孩子随即哇的一声哭了出来，呼吸瞬间通畅！
此事在京中传开，苏晚晚“神医”之名更盛。太医院内，那些原本对新法持怀疑态度的太医，亲眼目睹了这“奇技”救人性命，观念开始悄然转变。原来，医道并非只有汤药针石，这些看似“奇巧”的工具和方法，在关键时刻，竟能起死回生！
苏晚晚趁热打铁，在研习馆专门开设了一堂“急救异物梗阻”的课程，详细讲解了原理和操作方法。这一次，前来听讲的太医明显增多，甚至连几位须发花白的老太医，也戴着老花镜，坐在后面认真记录。
除了医术传授，苏晚晚也开始着手整顿太医院的药材管理与采购体系。她借鉴现代管理理念，建立了更为严格的入库、出库、盘点制度，要求所有药材必须标明产地、批次、入库时间，并引入了“抽样检验”机制，由专人定期对库存药材进行抽查，防止以次充好。采购方面，她打破了以往由内务府太监和固定药商垄断的局面，尝试引入几家信誉良好、药材品质有保障的新药商进行比价、竞价，并要求太医院派出懂药的太医参与验收。
这些改革措施，触动了太多人的利益，自然也引来了新的暗流。宫内宫外，关于她“标新立异”、“与民争利”（指触动原有药商利益）的议论再度悄然兴起。只是经历了李守仁倒台事件，无人再敢明目张胆地弹劾，更多的是隐藏在暗处的窥伺与怨怼。
这日午后，苏晚晚正在研习馆讲解“戾气”（可理解为传染病源）与“防疫”的关系，强调隔离、消毒的重要性。忽见胤祥身边的一名亲随匆匆而来，递上一封密信。
苏晚晚展开一看，眉头微蹙。信是胤祥所写，内容简短却令人心惊：“近日查得，京中多有来历不明之‘金丹’、‘仙散’流传，服之精神焕发，然久食成瘾，形销骨立，乃至暴毙。其药性诡谲，似与前朝方士所炼‘五石散’类同，然效力更烈。售卖者行踪诡秘，恐与‘暗夜’遗毒有关。望留意太医院用药，慎防此物流入宫中。”
“金丹”、“仙散”？效力更烈的“五石散”？苏晚晚心中警铃大作。她立刻想起陈实功笔记中对这类方士丹药的记载，多含有朱砂、雄黄、礜石等矿物毒素，短期服用确实能令人兴奋，但长期积累，会导致重金属中毒，损害神经和脏器，无异于慢性自杀。若此物流入宫中，被哪位主子甚至皇帝服用，后果不堪设想！
她立刻下令，严查太医院所有入库药材和成药，尤其是近期新增的品种，并暗中留意是否有太医私下配制或推荐类似功效的“秘方”。
同时，她也想起了返京途中，康亲王之孙弘晟似乎对医药颇有兴趣，且暗中打听过太医院和药商之事。此人……是否会与这流散的“金丹”有关？是单纯的好奇，还是别有牵连？
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